阿里云容器基因计算服务AGS

阿里云基因计算AGS由阿里云推出极速、低成本、高精度的基因组测序二级分析的云服务，提供以容器平台为基础的生物信息工作流服务和无需搭建集群，开箱即用的加速API服务。阿里云携手云巴巴提供一站式云计算产品选型和技术支持，拥有比官网更低的折扣和更完善的服务

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为什么选择阿里云容器基因计算服务AGS icon

极速、精准

整套方案在15分钟内完成了8组30X WGS样本二级分析处理。在保证精度的前提下，实现15分钟对7200亿碱基拼装、排序、去重、变异检测，完成基因检测全流程120倍加速。

成本大幅优化

阿里云ACK/AGS提供云上PaaS加速能力，以混合云方式协助华大基因完成自主测序仪大批量下机数据二级分析。同时实现二级分析计算行业内低成本，缩短交付周期95%。

适用场景广

容在保证分析通量的同时满足灵活性需求，可根据不同平台和数据定制分析流程。为各大测序服务商、研究机构等提供更简单更高效的存储、自动化分析、数据传输、项目协作以及生物信息工具开发等方面的解决方案。

简单易用

AGS凭借云端的自动伸缩特性，实现大规模弹性调度计算。该方案用户无需关心基因数据处理过程中的计算资源、处理逻辑、数据缓存等细节，只需将下机数据上传至OSS，以及授权Bucket给AGS服务，即可高效、快速完成整个数据分析流程。

任选弹性价格

价格体系

轻松解决行业挑战

数据突发高

大型基因测序公司每次下机

10TB -100TB ，每年产生数十PB

数据的处理和存储。

弹性效率差

线下机房SGE系统无法按需扩缩容，生物信息软件的运行特性CPU利用率低（～20%），计算成本越来越高（单位成本高，业务增长快）。

跨地域管理困难

测序仪分布于多个地域实验室，

多地域，多部门，安全控制，

管理复杂。

流程缺乏标准

5000+软件和流程，

流程管理和开发效率低

显而易见的技术优势

丰富多样的产品功能

通过AGS处理全基因组测序WGS

通过AGS可以快速处理全基因组测序WGS

（Whole Genome Sequencing）的全流程

任务，包括基因比对、排序、去重和变异检测。

群体多样本联合变异检测

对于一个家族或者相似的群体来说，变异往往

具有一定的相似性。通过对一个家族或者群体进行

联合变异的检测，可以有效提高变异检测的准确率。

通过AGS分析肿瘤样本

通过AGS调用mutect2任务来检测体细胞短突变，

短突变包括单核苷酸（SNV）以及插入和

缺失（InDel）的突变。

通过AGS排查病毒基因序列

在病原体鉴定过程中，通过对比待测样本与已

知病原体基因组数据库，可以高效准确的对待

测样本进行鉴定分析。AGS服务提供了针对宏

基因组测序数据的快速比对能力。

助力疫情，提供支撑

阿里云基因计算服务AGS提供了针对mNGS宏基因组测序数据的快速比对能力，对一组肺泡采样测序的宏基因组数据3.2Gbase（22M reads），60秒内可以完成和已知的病原体基因组包括新型冠状病毒SARS-CoV-2，39种BetaCov RNA，以及9334种已知病毒的参考序列的比对，并且支持自定义的病毒库的上传和比对。对于疾控中心，医院，实验室只需要一个阿里云的对象存储Bucket, 以及命令行ags就可以完成整个的比对过程，并拿到高质量的匹配reads的数据和初步质量报告，为多种病原体检测，进一步的新冠病毒的蛋白质研究和变异研究提供了快捷准确的数据支撑。

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